Autistische Kinder und Jugendliche identifizieren sich laut Untersuchungen deutlich häufiger als Transgender verglichen mit Kindern ohne Autismus-Spektrum-Störungen. Aktuelle Leitlinien aus verschiedenen Ländern empfehlen Untersuchungen auf neurologische Erkrankungen, darunter Autismus, bevor medizinische Maßnahmen bei Kindern und Jugendlichen mit Geschlechtsdysphorie durchgeführt werden.